以敏銳推力解決武術(shù)困難案件的高中生偵探工藤新一(溝端淳平 飾)深受媒體青睞，也得到了警視廳目暮警官(伊武雅刀 飾)的賞識(shí)。新一的學(xué)校決定舉辦為期三天的修學(xué)旅行。但在出行前一天，新一收到一封內(nèi)容為“修學(xué)旅行中，我將綁架你的同學(xué)”的挑戰(zhàn)書(shū)。上面還寫(xiě)著“只要保護(hù)好同學(xué)就是你贏，否則要你奉還‘高中生偵探’的名號(hào)。提示是船上”。一行人將于第一天在湖上巡航一小時(shí)。乘坐游船的除新一班級(jí)的30名學(xué)生之外，還有代理班主任北島慎吾，導(dǎo)游西田麻衣，還有船長(zhǎng)東邦夫和船員南田恭介。其間，小蘭的好友園子由于暈船，在船內(nèi)休憩室休息。但不久后就聽(tīng)到“啪沙”的激烈水花聲，船上一片騷動(dòng)。新一他們立即趕到休憩室，發(fā)現(xiàn)園子已失蹤，室內(nèi)留有爭(zhēng)斗痕跡。接手此案的縣警搜查本部搜查負(fù)責(zé)人多摩川刑警召開(kāi)了搜查會(huì)議。由于園子是鈴木財(cái)團(tuán)的千金，被勒索贖金的可能性極高。學(xué)生們被安排住進(jìn)現(xiàn)場(chǎng)附近的酒店。非常擔(dān)心園子的小蘭向開(kāi)偵探事務(wù)所的父親·毛利小五郎(陣內(nèi)孝則 飾)求助。其間，犯人竟大膽打來(lái)第二個(gè)綁架預(yù)告電話：“明天正午，我會(huì)再帶走一個(gè)人”新一班級(jí)的所有學(xué)生都被集中在酒店大廳，出入口全都上鎖，更有多摩川刑警指揮的縣警嚴(yán)陣以待。大家在緊張氣氛中迎來(lái)了正午時(shí)分，酒店突然停電。雖然迅速恢復(fù)了供電，新一卻發(fā)現(xiàn)身邊的小蘭忽然消失了。