經(jīng)過一番風波，一方通行找到了最后之作。最后之作玩到不小心跌倒受傷，一方通行只得去藥局買護理用品，卻有一個黑衣集團擋住去路。“獵犬部隊”――學園都市臺面下的這個組織，無預警就襲擊一方通行，其中還有一名白袍男性，曾經(jīng)參與一方通行能力開發(fā)的研究者――木原數(shù)多。木原數(shù)多破解一方通行的“矢量操作”將他打倒，并且不知為何宣稱要回收最后之作。努力抵抗的一方通行，在這時候才得知最后之作的真正用途。同一時間，某人癱瘓警備員的防衛(wèi)網(wǎng)，入侵大雨紛紛的學園都市。