盡管藤丸阻止了利用核彈爆炸毀掉東京的恐怖活動，但是當他看到被作為人質的葵死后的怪異模樣，心里受到很大沖擊。就在這時，折原瑪雅突然來到藤丸面前，藤丸堅信葵的死一定是瑪雅從中聯(lián)絡的，于是把所有的憤怒都發(fā)泄到她身上。與此同時，恐怖主義者的魔爪正悄悄伸向音彌和遙，藤丸很快就注意到了他們的奇怪變化。另一方面，THIRD-i注意到，一連串的恐怖事件都是名為“魔彈之射手”的恐怖組織犯下的罪行，而且在這個集團中，還有一個在黑客方面與藤丸不相上下的人物，他的名字是“Hornet”。這個恐怖組織的目的是“日本再啟動計劃”，而且他們還與J有關系，THIRD-i為了調查此事詢問J，而J表示可以說出整個恐怖計劃的內容，但是他也向霧島提出條件，就是與藤丸見面。